Постоянно действующими органами Ассоциации ИПДО являются:

1. Собрание Членов ИПДО, которое проводится в связи с Конференцией ИПДО;
2. Правление ИПДО во главе с Председателем Правления ИПДО;
3. Секретариат ИПДО под руководством Главы Секретариата.

В соответствии с Уставом Ассоциации ИПДО проводит Международную Конференцию как минимум один раз каждые три года (Статья 6). Она предоставляет заинтересованным сторонам ИПДО международный форум для продвижения целей ИПДО.  Попутно с Международными Конференциями проводится Собрание Членов с участием трех групп электоратов: страны, внедряющие и поддерживающие; компании, включая институциональных инвесторов; и общественные организации (Статья 7). Целью Собрания Членов является принятие всех решений путем консенсуса. В случае необходимости голосования голоса трех электоратов разделяются поровну. Основная функция Собрания членов – назначение Правления ИПДО (Статья 8). Электораты согласуют между собой свое членское представительство в Ассоциации и кого они желают номинировать в Правление ИПДО (Статья 5).

В период между этими Конференциями и Собраниями Членов Правление ИПДО осуществляет надзор за деятельностью ИПДО путем проведения регулярных заседаний Правления, заседаний Комитетов и часто выпускаемых циркуляров Правления (Статьи 12-14). Правление ИПДО состоит из 21 члена, уполномоченных представлять свои соответствующие электораты (Статья 9). Правление представляет Председатель Правления ИПДО (Статья 11). В настоящее время Председателем является Фредрик Рейнфельдт, и условия его контракта представлены здесь. 

Председатель Правления ИПДО:

• Выступает председателем на Собрании Членов ИПДО;
• Выступает председателем на заседаниях Правления ИПДО;
• Презентует отчет Правления ИПДО на Конференции ИПДО и Собрании Членов ИПДО;
• Выступает представителем Правления ИПДО по внешним вопросам;
• Работает с Секретариатом ИПДО по вопросам выполнения решений Правления ИПДО; и
• Способствует поддержанию сотрудничества между заинтересованными сторонами ИПДО.

Международный Секретариат ИПДО отвечает за повседневную работу Ассоциации ИПДО (Статья 15). Международный Секретариат возглавляет Глава Секретариата, который подотчетен перед Правлением ИПДО через Председателя (Статья 16)  Странам, внедряющим ИПДО, предоставляется значительный объем технической помощи. Значительная часть ее предоставляется Всемирным Банком. Имеется много других сторон, предоставляющих техническую помощь в процессах ИПДО, включая Германскую GIZ, региональные банки, Министерство международного развития Великобритании (DFID), правительства Норвегии и Австралии.

Структура управления ИПДО предоставляет заинтересованным сторонам ряд инструментов для выражения претензий и принятия соответствующих мер по ним.

Финансирование Ассоциации ИПДО как некоммерческой организации состоит из добровольных взносов Членов ИПДО и грантов двухсторонних и многосторонних спонсоров, международных финансовых организаций и других агентств, организаций и юридических лиц. Ассоциация ИПДО может также работать с использованием добровольных взносов в натуральной форме (Статья 17). Внедряющие страны оплачивают внедрение собственного процесса ИПДО. См. дополнительную информацию о финансировании ИПДО здесь.

Устав Ассоциации устанавливает следующее: "Каждый Электорат определяет собственные правила назначения Членов Ассоциации ИПДО" (Статья 5.3). Электораты также номинируют членов в Правление (Статья 8.1(ii)) и их замещающих лиц (Статья 9.4). Электораты и суб-электораты устанавливают руководящие указания для управления своими процессами номинации и зачастую - для улучшения подотчетности и обмена информацией внутри собственной группы. Когда они представляются в Международный Секретариат, они размещаются и обновляются, как указано ниже.

Устав Ассоциации обязывает Международный Секретариат вести постоянно обновляемый Реестр Членов (Статья 15.3). Самый недавний Реестр Членов  приводится здесь. Электораты должны постоянно сообщать Секретариату обо всех изменениях в своем членском составе (Статья 5.4). См. также руководящие указания для электоратов и суб-электоратов здесь.

В 2013 году ИПДО приняла Политику Открытости, которая устанавливает, как сама ИПДО должна обеспечивать свою прозрачность. В качестве главного принципа в ней отмечается, что документы ИПДО являются открытыми, за исключением ограниченного количества особых случаев. Политика Открытости ИПДО приводится в Части II Стандарта ИПДО.

По мере углубления и роста ИПДО она также продолжает улучшать собственное управление. Правление ИПДО имеет Комитет, который представляет рекомендации Правлению, в частности, по вопросам управления и надзора. Правление ИПДО регулярно проводит внутреннюю оценку и оценку третьими сторонами  своего управления. Это включает также выдвижение, по мере необходимости, предложений об изменении Устава Ассоциации на рассмотрение Собранием Членов (Статья 19).